AIZA cuenta con 4 grupos de trabajo. Su principal finalidad es proporcionar una red que promueva la comunicación y la colaboración entre los profesionales de las instituciones que forman AIZA. Cada grupo cuenta con un coordinador.

Los grupos de reúnen una vez al año. Estas reuniones proporcionan la oportunidad de compartir y ampliar conocimientos, debatir las experiencias que han tenido los diferentes zoos y acuarios, y también desarrollar actividades conjuntas.

Los miembros de cada grupo de trabajo disponen de un foro interno de direcciones electrónicas que se usa para canalizar el debate de temas de interés común.